投稿者: GoogleのDeepMindは2024年11月11日、タンパク質構造予測AIモデル「AlphaFold 3」のソースコードとモデルパラメータを学術利用向けに公開しました。今年5月から限定的に公開をしていましたが、約半年たち、正式にオープンソース化することを決定しました。
AlphaFold 3は、以前のモデルに比べ、タンパク質構造予測の精度が従来モデルより50%向上しているのが特徴です。さらに、タンパク質だけでなく、DNA、RNA、リガンドなど、生体分子全般の構造と相互作用を予測可能となりました。これまでに2億以上のタンパク質構造を予測し、データベース化しています。
利用条件としては、学術機関所属の研究者のみが利用可能で、非商用目的での使用に限定されます。モデルパラメータの使用には申請が必要ですが、3営業日以内に審査が行われます。
AlphaFold 3のオープンソース化により、創薬研究の加速や生物学的研究の効率化が期待されています。また、マラリアやパーキンソン病などの治療法開発にも貢献することが予想されます。
AlphaFoldを巡っては、開発者のDemis HassabisとJohn Jumperが2024年のノーベル化学賞を受賞しています。5月公表から当初はウェブサーバーを通じた限定的なアクセスのみが提供されていましたが、科学界からの批判を受けて、完全なオープンソース化へと方針を転換しました。
Googleにとっては、創薬会社等での利用については利用料の課金を行いつつ、研究者向けにオープンソース化することにより、今後の機能改善方針や新しい使い方の提案等、オープンソースコミュニティからのフィードバックを期待したいところだと思います。